描述

BioChain 的 cfPure® 無(wú)細(xì)胞 DNA 提取試劑盒旨在快速有效地純化循環(huán)無(wú)細(xì)胞 DNA (cfDNA)。該系統(tǒng)利用二氧化硅包被的順磁性顆粒來(lái)純化從小于 1 mL 到大于 10 mL 的血清或血漿中的無(wú)細(xì)胞 DNA。開發(fā)緩沖液以確保有效回收 100 bp – 500 bp DNA 片段，以最大限度地回收無(wú)細(xì)胞 DNA。回收的 DNA 適用于廣泛的下游應(yīng)用，例如亞硫酸氫鹽測(cè)序、NGS 和 qPCR。

應(yīng)用：

從血漿、血清和尿液中提取高質(zhì)量的無(wú)細(xì)胞 DNA，用于下一代測(cè)序 (NGS)、亞硫酸氫鹽測(cè)序、PCR、qPCR、ddPCR 和其他要求苛刻的應(yīng)用

優(yōu)點(diǎn)和特點(diǎn)：

• 多功能： 從<1mL 到>10mL 血清或血漿中提取——在單管或24 至96 孔板中

• 自動(dòng)化友好： 在 KingFisher™ 和液體處理儀器上，提取大約需要 50 分鐘

• 省時(shí)： 手動(dòng)提取協(xié)議不到 75 分鐘

• 具有成本效益： 從 1 mL 血漿中每次提取具有競(jìng)爭(zhēng)力的價(jià)格 < 3 美元（250 mL 試劑盒的標(biāo)價(jià)）

• 洗脫體積： 范圍從 15 µL 到 50 µL

快速高效的基于磁珠的方案

cfPure® 方案快速簡(jiǎn)便，允許用戶在一小時(shí)或更短的時(shí)間內(nèi)處理多個(gè)樣品，使其成為生物標(biāo)志物篩選的理想選擇。BioChain 開發(fā)了自己的二氧化硅涂層磁珠技術(shù)，該技術(shù)旨在在分離過(guò)程中有效回收低分子量無(wú)細(xì)胞 DNA。除了易于執(zhí)行和易于自動(dòng)化之外，如果您要純化少量血漿，您可以使用更少的磁珠解決方案 - 為您節(jié)省資金。成功分析cfDNA的關(guān)鍵是確保有效純化較小的 DNA 片段 (100-500 bp)。如圖 1 所示，cfPure® 無(wú)細(xì)胞 DNA 提取試劑盒確實(shí)有效地回收了這些重要的小片段。

cfPure – 可擴(kuò)展的無(wú)細(xì)胞 DNA 提取試劑盒：

Cfpure 被設(shè)計(jì)為可擴(kuò)展的套件（圖 2）。這意味著您可以僅使用 cfDNA 提取所需的磁珠和試劑量。這也意味著每個(gè)試劑盒的提取次數(shù)取決于您希望從中純化 DNA 的樣本量。例如，如果您處理 1mL 樣品，我們的 100mL 試劑盒（目錄號(hào) K5011610）最多可以處理 100 個(gè)樣品，而我們的 250 mL 試劑盒（目錄號(hào) K5011610）可以處理 250 個(gè)樣品。如果您處理 10mL 樣品，我們的 100mL 試劑盒（貨號(hào) #K5011610）最多可以處理 10 個(gè)樣品，而我們的250mL 無(wú)細(xì)胞 DNA 提取試劑盒（貨號(hào) #K5011625）可以處理 25 個(gè)樣品。

cfPure® 基于磁珠的純化的好處

與分離 cfDNA 的其他技術(shù)相比，磁珠具有許多優(yōu)勢(shì)。磁珠比玻璃纖維過(guò)濾器更有效地結(jié)合 DNA，從而產(chǎn)生更高和更一致的產(chǎn)量。此外，由于不使用過(guò)濾器和真空歧管，因此在提取過(guò)程中不存在細(xì)胞顆粒堵塞這些物品的風(fēng)險(xiǎn)。對(duì)于 cfDNA 研究中常用的富含蛋白質(zhì)的大體積樣品，例如血漿，這種堵塞問(wèn)題尤其令人擔(dān)憂。

最終用戶使用 NGS 驗(yàn)證的 cfDNA

cfPure® cfDNA 提取試劑盒提取的 cfDNA 非常適合下游應(yīng)用，如 NGS。在第三方研究中，cfDNA 是使用 BioChain 的 cfPure® (B)、競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手 T's(T) 和競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手 Q's（Q，基于柱）cfDNA 提取試劑盒從 4 位捐贈(zèng)者的 10 毫升人血漿中提取的。然后為每個(gè)樣本構(gòu)建文庫(kù)，并進(jìn)行全基因組測(cè)序。從數(shù)據(jù)分析來(lái)看，三種提取方法沒(méi)有顯示出顯著的性能差異：插入大小（圖 3.）、映射率、全基因組覆蓋率、替換率和 GC 偏差（圖 4.）。

cfDNA 的可重現(xiàn)和高效回收

我們優(yōu)化的基于磁珠的協(xié)議使用戶能夠擴(kuò)展協(xié)議以用于從 100 µl 到 10 ml 的任何樣品體積，具有高度可重復(fù)的結(jié)果和高效的 cfDNA 回收率（表 1 和 2）。

cfPure® 無(wú)細(xì)胞 DNA 提取試劑盒適用于 KingFisher™（圖 5）和液體處理儀器。使用 KingFisher™ Flex 和 BioChain 的 cfPure® 無(wú)細(xì)胞 DNA 提取試劑盒，可以在 50 分鐘內(nèi)提取多達(dá) 96 個(gè) 1 毫升樣本，或在一小時(shí)內(nèi)提取 24 個(gè) 5 毫升樣本。

cfPure_600ul_Flex.bdz

cfPure_1-2ml_Flex.bdz

cfPure_4-5ml_Flex.bdz